NVIDIA 的 BioNeMo 推理运行时提升蛋白质建模

NVIDIA 推出了 BioNeMo 推理运行时（BioIR），这是一个针对 GPU 优化的库，旨在加速生物分子结构预测。通过在药物发现和蛋白质建模中的应用，BioIR 显著提高了计算吞吐量，与开源实现相比，残基归一化折叠吞吐量提升了 2.9 倍。这种效率对于扩展蛋白质组规模任务（例如扩展 AlphaFold 数据库的项目）至关重要。

BioIR 支持两种工作流：结构预测的端到端处理器和直接用于自定义模型的 PyTorch 集成。通过利用 NVIDIA GPU、CUDA 图和优化内核，BioIR 缩短了模型推理时间并提高了吞吐量。对于大规模数据集，Ray 后端支持跨多个 GPU 的并行处理，进一步提升了运行时的效率。

在涉及 1,000 个人体二聚体蛋白目标的基准测试中，BioIR 在 8 个 H100 GPU 上实现了每 GPU 每小时 58,500 个折叠残基——相比公共实现的性能提高了近三倍。此外，BioIR 展现了更高的能源效率，在扩展到一百万个目标时，比开源同行减少了 23 兆瓦时的能源消耗。

这种性能对药物发现工作流具有实际意义，在这些工作流中，快速且准确的生物分子建模至关重要。NVIDIA 将 BioIR 定位为其更广泛 BioNeMo 平台的一部分，该平台包括如 BioNeMo Agent Toolkit 等工具。这些产品旨在简化 AI 驱动的生命科学研究，支持分子生成、蛋白质设计和基因组分析等任务。

对于交易员和投资者来说，NVIDIA 在基于 GPU 的 AI 解决方案上的持续进步巩固了其在计算生物学和科学发现领域的领先地位。截至 2026 年 9 月 10 日，NVIDIA 的股票价格为 218.62 美元，市值达到 5.31 万亿美元。公司在生命科学领域可扩展 AI 基础设施的专注可能进一步推动其在制药研发这一快速增长的市场细分中的采用。

研究人员和开发人员可以通过其 GitHub 仓库 探索 BioNeMo 推理运行时的功能。对于更高级的工作流，BioNeMo Agent Toolkit 提供了将 AI 代理集成到药物发现管道中的工具。